Nama : Siti Zahrah Auliaur Rahim
NIM : 4111171042
Dewasa ini, dengan adanya berbagai macam modifikasi genetik
dapat dihasilkan produk mutasi genetik pada tanaman bahkan hewan, seperti
buah-buahan tanpa biji atau ikan zebra yang berflueresensi. Lalu, apakah ada
teknologi modifikasi genetik yang dapat diaplikasikan pada manusia? Ya. Salah satunya
adalah teknologi CRISPR-Cas9 yang bisa
mengatasi berbagai penyakit genetik bahkan memodifikasi gen agar memiliki
sifat-sifat yang diinginkan. Teknologi ini diciptakan oleh seorang Profesor
Kimia Molekul dan Sel Biologi Jennifer Doudna dan rekannya Emmanuelle
Charpentier dan telah diuji pada tikus, monyet, serta organisme lainnya.
Apa yang dimaksud dengan CRISPR dan Cas9?
CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short
Palindromic Repeats) adalah sistem kekebalan adaptif yang ada di dalam sel
bakteri yang memungkinkan bakteri untuk mendeteksi DNA virus dan
menghancurkannya. Cas9 adalah protein yang menjadi bagian dari CRISPR dan mampu
mencari, memotong, serta menurunkan DNA virus dengan cara tertentu.
Bagaimana cara kerja teknologi CRISPR-Cas9?
Pertama, mari kita baca terlebih dahulu mengenai
mekanisme sel bakteri saat mendeteksi dan menghancurkan virus. Saat virus
menginfeksi sel bakteri, virus menyuntikkan DNA-nya. Nah, sistem CRISPR ini
memungkinkan DNA untuk “dipetik” dari virus , dimasukkan ke dalam potongan
kecil ke dalam kromosom bakteri, lalu dibuat salinan berupa RNA. RNA tersebut
akan “bekerjasama” dengan Cas9 membentuk sebuah kompleks dan mencari DNA yang
sekuens-nya sesuai dengan sekuens RNA tersebut di seluruh sel bakteri. Ketika kompleks
itu menemukan DNA yang dicari, maka Cas9 akan berperan sebagai gunting untuk
memotong DNA virus.
Sebenarnya, sel-sel memiliki kemampuan mendeteksi DNA
yang rusak dan memperbaikinya. Jika kita mampu memprogram teknologi CRISPR-Cas9
untuk membuat pemotongan DNA pada posisi di atau dekat mutasi, kita juga bisa memicu
sel untuk memperbaikinya. Oleh karena itulah para penemu teknologi CRISPR-Cas9
membayangkan penggunaan teknologi tersebut.
Bagaimana CRISPR membuat kita meng-edit DNA kita
GT Scan
Salah satu tool
atau alat yang digunakan untuk teknologi ini adalah GT Scan. GT Scan ini
merupakan sebuah alat berbasis web yang fleksibel dan berguna untuk memindai
region genomik untuk mencari target kandidat. Yang dimaksud dengan target
kandidat disini adalah sekuens DNA yang sesuai dengan target yang diinginkan. Output
dari GT Scan ini interaktif. Selain dapat memindai untuk target kandidat, GT Scan
juga dapat memeriksa karakteristik dari target yang salah dan me-ranking target sesuai dengan banyaknya
kesalahan.
Contoh Output pada GT Scan
Untuk menggunakan GT Scan, pengguna memilih genom yang
diinginkan dari menu lalu menyesuaikan genom tersebut ke dalam region genomik
untuk mengidentifikasi target yang optimal. Lalu pengguna memilih aturan target
atau target rule dan filter target
yang salah atau off target-filter.
Referensi :
- https://www.google.co.id/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=1&cad=rja&uact=8&ved=0ahUKEwjot-uZ6JrWAhUJqo8KHfV8BAcQFggnMAA&url=http%3A%2F%2Ffarmasetika.com%2F2017%2F01%2F11%2Fpenemu-crispr-cas9-ungkap-teknologi-edit-dna-yang-bisa-mengubah-segalanya%2F&usg=AFQjCNHstRtdCOJF846-G9V5wBu1FPSsDw
- https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/18/2673/2475622/GT-Scan-identifying-unique-genomic-targets
- https://www.youtube.com/watch?v=TdBAHexVYzc
Referensi :
- https://www.google.co.id/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=1&cad=rja&uact=8&ved=0ahUKEwjot-uZ6JrWAhUJqo8KHfV8BAcQFggnMAA&url=http%3A%2F%2Ffarmasetika.com%2F2017%2F01%2F11%2Fpenemu-crispr-cas9-ungkap-teknologi-edit-dna-yang-bisa-mengubah-segalanya%2F&usg=AFQjCNHstRtdCOJF846-G9V5wBu1FPSsDw
- https://academic.oup.com/bioinformatics/article/30/18/2673/2475622/GT-Scan-identifying-unique-genomic-targets
- https://www.youtube.com/watch?v=TdBAHexVYzc





